Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX7O95931 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX7O95931 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX7O95931 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX7O95931 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX7O95931 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX7O95931 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX7O95931 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX7O95931 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX7O95931 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX7O95931 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX7O95931 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX7O95931 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX7O95931 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX7O95931 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX7O95931 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms