Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms