Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETM1O95202 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETM1O95202 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETM1O95202 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LETM1O95202 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETM1O95202 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETM1O95202 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETM1O95202 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETM1O95202 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETM1O95202 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETM1O95202 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETM1O95202 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LETM1O95202 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LETM1O95202 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LETM1O95202 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETM1O95202 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM1O95202 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM1O95202 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM1O95202 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM1O95202 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM1O95202 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM1O95202 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETM1O95202 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms