Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms