Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCF11O94913 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCF11O94913 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCF11O94913 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCF11O94913 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCF11O94913 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCF11O94913 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PCF11O94913 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCF11O94913 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCF11O94913 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCF11O94913 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCF11O94913 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCF11O94913 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCF11O94913 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCF11O94913 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCF11O94913 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCF11O94913 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PCF11O94913 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCF11O94913 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCF11O94913 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCF11O94913 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCF11O94913 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCF11O94913 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
PCF11O94913 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCF11O94913 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCF11O94913 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCF11O94913 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCF11O94913 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCF11O94913 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PCF11O94913 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PCF11O94913 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCF11O94913 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCF11O94913 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCF11O94913 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCF11O94913 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PCF11O94913 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PCF11O94913 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PCF11O94913 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCF11O94913 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCF11O94913 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCF11O94913 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCF11O94913 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCF11O94913 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCF11O94913 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCF11O94913 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PCF11O94913 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCF11O94913 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCF11O94913 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCF11O94913 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCF11O94913 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCF11O94913 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCF11O94913 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCF11O94913 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCF11O94913 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCF11O94913 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCF11O94913 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCF11O94913 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms