Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL2O75678 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL2O75678 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms