Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRP6O75581 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRP6O75581 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRP6O75581 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRP6O75581 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRP6O75581 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRP6O75581 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRP6O75581 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRP6O75581 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRP6O75581 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRP6O75581 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRP6O75581 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRP6O75581 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRP6O75581 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRP6O75581 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRP6O75581 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRP6O75581 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRP6O75581 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRP6O75581 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRP6O75581 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRP6O75581 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP6O75581 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP6O75581 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP6O75581 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP6O75581 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP6O75581 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP6O75581 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP6O75581 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP6O75581 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP6O75581 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP6O75581 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP6O75581 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP6O75581 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP6O75581 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP6O75581 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP6O75581 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP6O75581 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP6O75581 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP6O75581 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP6O75581 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRP6O75581 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRP6O75581 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRP6O75581 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LRP6O75581 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRP6O75581 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRP6O75581 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRP6O75581 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRP6O75581 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRP6O75581 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRP6O75581 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LRP6O75581 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRP6O75581 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRP6O75581 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRP6O75581 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRP6O75581 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRP6O75581 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRP6O75581 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRP6O75581 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRP6O75581 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRP6O75581 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRP6O75581 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRP6O75581 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRP6O75581 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRP6O75581 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRP6O75581 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRP6O75581 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRP6O75581 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRP6O75581 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRP6O75581 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRP6O75581 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRP6O75581 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRP6O75581 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRP6O75581 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRP6O75581 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRP6O75581 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRP6O75581 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRP6O75581 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRP6O75581 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRP6O75581 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRP6O75581 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRP6O75581 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRP6O75581 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms