Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH16O75309 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH16O75309 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH16O75309 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH16O75309 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH16O75309 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH16O75309 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH16O75309 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH16O75309 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH16O75309 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH16O75309 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH16O75309 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH16O75309 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH16O75309 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH16O75309 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH16O75309 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH16O75309 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH16O75309 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH16O75309 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH16O75309 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH16O75309 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH16O75309 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH16O75309 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH16O75309 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH16O75309 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH16O75309 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH16O75309 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH16O75309 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH16O75309 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH16O75309 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH16O75309 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH16O75309 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH16O75309 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms