Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPINK4O60575 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINK4O60575 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINK4O60575 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINK4O60575 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINK4O60575 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINK4O60575 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINK4O60575 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINK4O60575 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINK4O60575 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINK4O60575 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINK4O60575 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms