Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY75O60449 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY75O60449 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY75O60449 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LY75O60449 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY75O60449 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY75O60449 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY75O60449 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LY75O60449 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LY75O60449 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LY75O60449 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LY75O60449 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LY75O60449 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LY75O60449 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LY75O60449 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LY75O60449 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LY75O60449 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LY75O60449 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LY75O60449 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LY75O60449 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LY75O60449 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LY75O60449 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LY75O60449 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LY75O60449 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms