Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIAA0556O60303 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms