Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DENRO43583 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DENRO43583 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DENRO43583 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DENRO43583 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DENRO43583 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DENRO43583 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DENRO43583 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DENRO43583 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DENRO43583 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DENRO43583 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DENRO43583 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DENRO43583 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DENRO43583 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DENRO43583 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DENRO43583 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DENRO43583 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DENRO43583 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms