Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF14O43557 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF14O43557 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms