Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms