Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms