Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIPA1L1O43166 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms