Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM6AO15550 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms