Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms