Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLGNO14967 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLGNO14967 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLGNO14967 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLGNO14967 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLGNO14967 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLGNO14967 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLGNO14967 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLGNO14967 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLGNO14967 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLGNO14967 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLGNO14967 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLGNO14967 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLGNO14967 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms