Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms