Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PITPNM1O00562 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM1O00562 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms