Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QW42 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QW42 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QW42 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QW42 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QW42 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QW42 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QW42 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QW42 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QW42 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QW42 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QW42 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QW42 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms