Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms