Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms