Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1CA8MV81 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms