Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms