Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DBX1A6NMT0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms