Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF233A6NK53 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms