Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms