Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms