Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms