Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SSC5DA1L4H1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSC5DA1L4H1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSC5DA1L4H1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms