Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms