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| PTPRJ | Q12913 | PCSK2-202 | ENST00000377899 | 4674 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRIM62-201 | ENST00000291416 | 3437 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | UTP14A-202 | ENST00000425117 | 2403 nt | TSL 2 BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LRRC8A-202 | ENST00000372599 | 4161 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC131212.2-201 | ENST00000622917 | 1355 nt | BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SEC14L1P1-201 | ENST00000534767 | 2181 nt | BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SFRP1-202 | ENST00000379845 | 3873 nt | TSL 2 BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TYRL-201 | ENST00000243152 | 441 nt | BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MCEE-201 | ENST00000244217 | 835 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ATP6V1G2-206 | ENST00000376151 | 1261 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PARK7-202 | ENST00000377488 | 783 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CAPG-204 | ENST00000409724 | 1151 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC010442.2-201 | ENST00000509301 | 407 nt | BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | BARD1-201 | ENST00000260947 | 5499 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IL7-201 | ENST00000263851 | 2076 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | USP38-201 | ENST00000307017 | 7009 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STX16-202 | ENST00000355957 | 4897 nt | TSL 2 BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GATAD2A-201 | ENST00000358713 | 5510 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BAG6-247 | ENST00000439687 | 3104 nt | TSL 2 BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ADGRE5-202 | ENST00000357355 | 3054 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BRD1-202 | ENST00000404034 | 4312 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.5 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NUAK2-201 | ENST00000367157 | 3441 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | POU2F2-216 | ENST00000560558 | 3282 nt | TSL 5 BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DGKA-229 | ENST00000551156 | 2671 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CHD3-203 | ENST00000380358 | 7356 nt | TSL 2 BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | GTF2I-218 | ENST00000620879 | 4352 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PABPC1P11-201 | ENST00000428966 | 2007 nt | BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VWA8-203 | ENST00000379310 | 7147 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NCDN-202 | ENST00000373243 | 3683 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | C19orf44-201 | ENST00000221671 | 3427 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TMEM168-201 | ENST00000312814 | 7470 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | CRCT1-201 | ENST00000368790 | 700 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PRKCQ-201 | ENST00000263125 | 3285 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PAPLN-208 | ENST00000555445 | 4282 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PTPRG-201 | ENST00000295874 | 4650 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MROH1-211 | ENST00000544576 | 3673 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KLHL7-202 | ENST00000339077 | 5620 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PLEKHG4-202 | ENST00000379344 | 4513 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | KDM7A-201 | ENST00000397560 | 9272 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | WDR73-202 | ENST00000434634 | 5387 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DNM3-206 | ENST00000520906 | 4454 nt | TSL 2 BASIC | 12.49 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ATP6V1H-203 | ENST00000396774 | 1892 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ABI1-204 | ENST00000376138 | 3503 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CFAP52-201 | ENST00000352665 | 2193 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAGEB1-203 | ENST00000397550 | 1782 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RBFOX2-203 | ENST00000397303 | 1354 nt | TSL 5 BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HKDC1-201 | ENST00000354624 | 3689 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TP73-206 | ENST00000378288 | 5120 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PROCR-201 | ENST00000216968 | 1348 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ITGAM-201 | ENST00000287497 | 3595 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TFIP11-204 | ENST00000407690 | 3586 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CAD-201 | ENST00000264705 | 7265 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C1orf186-201 | ENST00000331555 | 1665 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARFGAP3-203 | ENST00000437119 | 1650 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC18A1-202 | ENST00000276373 | 2753 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NEK10-204 | ENST00000383771 | 2023 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FBXO16-201 | ENST00000346498 | 1205 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LYZL2-201 | ENST00000375318 | 818 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KRTAP4-9-201 | ENST00000391415 | 1157 nt | APPRIS P1 BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC02054-201 | ENST00000419960 | 885 nt | TSL 3 BASIC | 12.48 | □□□□□ -0.41 | | |