Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC108174.1-201ENST00000504916 745 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC113410.2-201ENST00000507389 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC104371.1-201ENST00000522077 797 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AP005018.2-201ENST00000528464 822 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 TMEM263-202ENST00000547081 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC124312.3-201ENST00000567527 1236 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ACAP1-204ENST00000570504 274 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC060764.1-201ENST00000603811 454 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 NAMA-205ENST00000605043 551 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC004494.2-201ENST00000623168 830 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 TAF1A-AS1-201ENST00000413074 1313 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ACTN4P1-201ENST00000514175 1451 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 FRG2DP-203ENST00000569028 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ODF2-206ENST00000393533 2086 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 LINC00327-201ENST00000443778 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 RBM28-202ENST00000415472 2251 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PHACTR3-205ENST00000395636 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ELF5-202ENST00000312319 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 TARS2-204ENST00000369064 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC093330.2-201ENST00000624814 3998 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ZNF839-206ENST00000558850 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 LINC00910-202ENST00000586231 2890 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 GALNT11-208ENST00000434507 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 OPRM1-209ENST00000435918 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 NKIRAS1-205ENST00000421515 2018 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC142086.1-201ENST00000566260 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 MED8-201ENST00000290663 1483 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PFDN1-201ENST00000261813 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 CYB5A-201ENST00000299438 718 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 EDNRA-202ENST00000358556 3823 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SLC6A1-AS1-201ENST00000414969 584 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 KCNK16-203ENST00000425054 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ATF4P3-201ENST00000433309 1056 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ZEB2-214ENST00000462355 656 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC108482.1-201ENST00000523413 722 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AP001972.2-201ENST00000529304 216 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ACP2-209ENST00000530453 826 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ARL1-209ENST00000551671 879 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 DIO2-206ENST00000555750 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 MT3-206ENST00000570176 579 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC008555.5-202ENST00000604749 570 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AL360272.1-201ENST00000605501 585 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 GGNBP1-203ENST00000612409 592 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AL137786.1-201ENST00000553378 3030 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 CYP11B2-201ENST00000323110 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PIGO-201ENST00000298004 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ARL3-201ENST00000260746 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 CYBRD1-202ENST00000375252 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 CARD8-215ENST00000520015 1931 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AP4B1-AS1-201ENST00000419536 1734 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PKD2-205ENST00000508588 1720 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PCID2-206ENST00000375479 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 POTEB2-202ENST00000454856 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ABRA-201ENST00000311955 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ATAD3C-201ENST00000378785 3859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms