Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ASAH1-202ENST00000314146 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 PARD3B-201ENST00000349953 3315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ACTG2-202ENST00000409624 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 CLP1-203ENST00000529430 1778 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 CCDC81-204ENST00000528728 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 INSC-201ENST00000379554 2954 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 CPEB4-207ENST00000519835 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 TP53-202ENST00000359597 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 OR7E23P-201ENST00000435600 1048 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 CR769776.2-201ENST00000445057 378 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 TEX51-204ENST00000450035 736 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC099541.1-201ENST00000453828 670 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 TMEM255B-205ENST00000488362 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ARHGAP44-212ENST00000616670 884 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC244093.4-201ENST00000620689 710 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 PGM2-206ENST00000625312 661 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 TROAP-215ENST00000551245 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 CWC25-202ENST00000614790 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AMER3-201ENST00000321420 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 RIC3-203ENST00000343202 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 RN7SL614P-201ENST00000461850 280 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 AL117694.1-201ENST00000555136 300 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 TRAPPC2L-202ENST00000561840 558 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC010551.1-201ENST00000568458 469 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC009171.2-201ENST00000573220 318 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC061992.1-202ENST00000587575 490 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AP001059.2-201ENST00000620163 449 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AL138921.3-201ENST00000636357 992 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SLC24A3-202ENST00000613834 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 FBXO25-201ENST00000276326 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 C22orf23-201ENST00000249079 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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