Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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SNX13Q9Y5W8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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SNX13Q9Y5W8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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SNX13Q9Y5W8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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SNX13Q9Y5W8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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SNX13Q9Y5W8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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SNX13Q9Y5W8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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SNX13Q9Y5W8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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SNX13Q9Y5W8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX13Q9Y5W8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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