Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms