Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRBQ9Y5M8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms