Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms