Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms