Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXND1Q9Y4D7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms