Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms