Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms