Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL11Q9Y3B7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL11Q9Y3B7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms