Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED5Q9Y3A6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms