Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
AP3M1Q9Y2T2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3M1Q9Y2T2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms