Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms