Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSAQ9Y285 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms