Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOD1Q9Y239 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOD1Q9Y239 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms